郝春秋 彭梅娟 谢玉梅 周云 魏欣 马力 王素娜 李瑞娟 张岩 白雪帆 贾战生*
第四军医大学唐都医院感染病诊疗中心,陕西 西安 710038
【摘要】目的 构建能介导CTGF基因RNA干扰的复制缺陷型腺病毒表达载体。方法 以大鼠CTGF基因为靶序列,设计并合成含编码短发夹RNA( shRNA) 序列的寡核苷酸, 构建腺病毒穿梭质粒p-shuttle-CTGF, 酶切及测序分析正确后,与腺病毒骨架质粒pAdEasy-1共转染AD-293细胞,进行病毒包装。用所得腺病毒载体Ad.H1-CTGF感染HSC-T6细胞,观察其对CTGF基因表达抑制的效果。结果 构建的腺病毒穿梭质粒p-shuttle-CTGF经酶切、测序分析证实正确。包装的病毒载体滴度为4×1010 PFU/ml,感染HSC-T6细胞后,Western blot 证实CTGF表达显著减少。结论 构建的腺病毒载体Ad.H1-CTGF可有效抑制HSC-T6中CTGF的表达,为抗纤维化研究提供了有力的工具。
【关键词】 结缔组织生长因子; RNA干扰; 腺病毒载体
Construction and identification of replication-deficient adenovirus vector for RNA interference with CTGF gene.
HAO Chun-qiu, PENG Mei-juan, XIE Yu-mei,ZhOU Yun, WEI Xin,WANG Su-na, LI Rui-juan, ZHANG Yan, BAI Xue-fan, JIA Zhan-sheng*
Center of Infectious Diseases of Chinese PLA, Affiliated Tangdu Hospital, Fourth Military Medical University, Xi’an 710038, China
【Abstract】Objective:To construct a replication-deficient recombinant adenovirus vector that expresses small interference RNA (siRNA) against the CTGF gene. Methods: The siRNA sequence targeting CTGF mRNA was synthesized and shuttle plasmid p-shuttle-CTGF was constructed, which was co-transfected into AD-293 cells with the bone plasmid pAdEasy-1 to obtain the homologous recombination adenovirus vector Ad.H1-CTGF. The concentration of CTGF protein in HSC-T6 cells infected with adenovirus vector Ad.H1-CTGF was determined by Wetsern blot.Results: The p-shuttle-CTGF was identified by endonuclease and sequencing. The adenovirus vector Ad.H1-CTGF was successfully constructed with the titre of 4×1010 PFU/ml by purification. The concentration of CTGF protein in HSC-T6 cells was decreased observably after Ad.H1-CTGF infected by Western blot. Conclusion: The constructed Ad.H1-CTGF can effectively inhit the expression of CTGF in HSC-T6 cells,which provided a powerful tool for anti-fibrosis study.
Keywords CTGF(connective tissue growth factor); RNA interference;
adenovirus vector;
腺病毒具有宿主范围广、感染率高、包装容量大、繁殖滴度高、安全性好、性质稳定、载体制备较容易等特点[1], 已成为应用最广泛的载体系统之一。结缔组织生长因子(CTGF)是重要的促组织纤维化蛋白,与肝、肺、肾等许多器官的纤维化密切相关[2],特别是促进胶原沉积致肝纤维化的主要细胞因子。RNA干扰(RNAi)可以在转录后水平阻断基因表达,使靶基因沉默,是研究特定基因功能的可靠技术[3]。本课题试图利用RNA干扰原理,构建能介导CTGF基因沉默的复制缺陷型腺病毒载体,为肝纤维化的防治提供一个有用的工具。
[基金项目]:国家自然科学基金项目(30571658)
[作者简介]:郝春秋(1965-),男,博士,副主任医师,副教授
[通讯作者]:贾战生,(E-mail)haochq@fmmu.edu.cn
1 材料和方法
1.1材料
1.1.1 质粒、菌株及细胞:腺病毒载体系统(穿梭质粒pShuttle-H1、骨架质粒pAdEasy-1及包装细胞AD-293)由德国学者Reske SN 教授惠赠;大鼠肝星状细胞系HSC-T6购自ATCC;大肠杆菌BJ-5183和DH5a由本实验室保存。
1.1.2 主要试剂及工具酶: Hind Ⅲ、BglⅡ、T4DNA连接酶、Taq DNA聚合酶、dNTP、PCR产物回收试剂盒及Plasmid Purification Kit 均为Promega 公司产品; 脂质体Lipofectamine 2000、 DMEM、RPMI 1640及胎牛血清均为Gibco公司产品; 抗CTGF单克隆抗体、抗β-actin抗体购自Abcam公司;山羊抗鼠IgG-HRP抗体购自Santa Cruz公司。
1.2 方法
1.2.1 靶向CTGF短发夹RNA的设计:根据小干扰RNA(siRNA)设计原则[4-5],,参考GenBank公布的大鼠CTGF(NM-022266)核苷酸序列,利用Ambion公司在http:// www.ambion.com)设计工具,设计4对针对CTGF基因的siRNA序列(TS1-TS4)和1对无关阴性对照序列(TS5),并进行BLAST 同源性分析,保证序列的唯一性。为方便克隆与鉴定,在其5’端和3’端分别引入BglⅡ和Hind Ⅲ酶切位点,反义片段以后接终止信号TTTTTT以终止转录。形成BglⅡ酶切位点+19nt正义靶序列+9nt loop接头序列+19nt反义靶序列+终止信号+Hind Ⅲ酶切位点的结构(寡核苷酸由上海吉凯基因技术有限公司合成)。序列信息如下:
表1 编码siRNA的DNA双链体
|
5’ |
Sensen |
Loop |
Antisense |
3’ |
TS1-1 TS1-2 |
AGA |
agAACATGATGTTCATCAAGA |
TTCAAGAGA |
TCTTGATGAACATCATGTTct |
TTTTTTA |
AGCTTAAAAAA |
agAACATGATGTTCATCAAGA |
TCTCTTGAA |
TCTTGATGAACATCATGTTct |
TCT |
|
TS2-1 TS2-2 |
AGA |
agCAGTTGCAAATACCAGTGC |
TTCAAGAGA |
GCACTGGTATTTGCAACTGct |
TTTTTTA |
AGCTTAAAAAA |
agCAGTTGCAAATACCAGTGC |
TCTCTTGAA |
GCACTGGTATTTGCAACTGct |
TCT |
|
TS3-1 TS3-2 |
AGA |
agACGTTTGTGCCTATTGTTC |
TTCAAGAGA |
GAACAATAGGCACAAACGTct |
TTTTTTA |
AGCTTAAAAAA |
agACGTTTGTGCCTATTGTTC |
TCTCTTGAA |
GAACAATAGGCACAAACGTct |
TCT |
|
TS4-1 TS4-2 |
AGA |
caCTGCCGGTGGAGTTCAAGT |
TTCAAGAGA |
ACTTGAACTCCACCGGCAGtg |
TTTTTTA |
AGCTTAAAAAA |
caCTGCCGGTGGAGTTCAAGT |
TCTCTTGAA |
ACTTGAACTCCACCGGCAGtg |
TCT |
|
TS5-1 TS5-2 |
AGA |
TTCTCCGAACGTGTCACGT |
TTCAAGAGA |
ACGTGACACGTTCGGAGAA |
TTTTTTA |
AGCTTAAAAAA |
TTCTCCGAACGTGTCACGT |
TCTCTTGAA |
ACGTGACACGTTCGGAGAA |
TCT |
1.2.2 腺病毒穿梭质粒p-shuttle-CTGF的构建及鉴定:将合成的单链寡核苷酸退火形成双链DNA并检测无误。用BglⅡ和HindⅢ双酶切穿梭质粒pShuttle-H1(图1), 酶切产物纯化后, 用T4噬菌体DNA连接酶16℃连接线性化的pShuttle-H1及退火后的双链DNA 12h , 转化DH5A感受态细菌, 在含有卡那霉素抗性的LB平板上37℃培养过夜, 筛选扩增转化的阳性菌落, 提取质粒并纯化后获得腺病毒穿梭质粒p-shuttle-CTGF,应用EcoR I 酶切鉴定, 并将酶切后获得的小片段回收进行测序分析。
图1:腺病毒穿梭质粒p-shuttle-H1图谱及构建示意图
1.2.3 复制缺陷型腺病毒载体Ad.H1-CTGF的包装和滴定:培养腺病毒包装细胞AD-293, 达80%~90%汇合时, 加入鉴定无误的腺病毒穿梭质粒p-shuttle-CTGF 1ug与骨架质粒pAdEasy-1 4ug, 用Lipofectamine2000脂质体转染,使之进行同源重组,第2天传代。转染7~10d后,75%~80%细胞出现CPE时收集细胞,-80℃和37℃反复冻融3次释毒, 离心冻融液收集上清,即为第一代腺病毒载体Ad.H1-CTGF毒种,作为随后大量病毒扩增的原液,3次扩增后获得病毒保存液。同法获得无关阴性对照病毒Ad.H1-Con原液及保存液,均-80℃保存。病毒的滴定采用TCID50法,即将病毒原液按10-6~10-127个浓度梯度稀释,分别接种生长于96孔培养皿的AD-293细胞,37℃培养72h,用X-gal染色,计算病毒滴度。
1.2.4 空斑实验检测腺病毒载体的感染性:将肝星状细胞系HSC-T6细胞低密度铺于6孔板中,培养1d后达60%~70%融合,用MOI(multiple of infection)为100的腺病毒载体Ad.H1-CTGF和阴性对照病毒Ad.H1-Con感染细胞,未感染病毒的细胞为对照,加甲基纤维素覆盖液后37℃培养7d,吸除覆盖液加结晶紫染色、清洗后观察空斑形成情况。
1.2.5 Western Blot检测病毒载体CTGF基因沉默效果:HSC-T6细胞于6孔板中培养1d达60%~70%融合后,用MOI为100的腺病毒载体Ad.H1-CTGF1~4和阴性对照病毒Ad.H1-Con感染细胞,37℃培养48h后裂解细胞、提取蛋白,进行SDS-PAGE凝胶电泳, 然后将蛋白条带电转移到硝酸纤维素膜上,以抗CTGF单克隆抗体为一抗(1:10)、山羊抗鼠IgG-HRP抗体为二抗(1:100)进行Western Blot,检测腺病毒载体对CTGF基因的沉默效果。
2 结果
2.1 含靶序列的单链寡核苷酸退火产物检测:
将合成的4对含靶序列、1对阴性对照序列的单链寡核苷酸90℃温育4min、70℃温育10min,缓慢冷却至室温进行退火,用12%非变性PAGE检测退火形成双链DNA的效率,均达90%以上(图2),提示退火产物合格,可以用来构建腺病毒穿梭质粒。
泳道:1:单链对照(单链,发卡结构);2:双链对照【从上到下:双链(>90%),
线性单链(<5%),发卡结构单链(<5%)】;3-6:TS1-TS4;7: TSNC(阴性对照)
图2 退火产物电泳图
2.2 腺病毒穿梭质粒p-shuttle-CTGF的鉴定:
由腺病毒穿梭质粒p-shuttle-H1图谱(图1)可看出,MCS中含有2个EcoR I 酶切位点,EcoR I酶切后形成两个片段,大片段6600bp,小片段为300bp的H1启动子序列。如在BglⅡ和HindⅢ位点之间成功插入合成的寡核苷酸靶序列后,小片段长度则变为为360bp。电泳结果(图3)显示,阴性对照质粒p-shuttle-H1酶切小片段为300bp, 阳性克隆质粒p-shuttle-CTGF酶切小片段为360bp,大片段均为6600bp,初步证明重组腺病毒穿梭质粒构建正确。回收360bp小片段进行测序分析,证实序列完全正确(基因序列略)。
1 Marker(DL-2000); 2 空载体p-shuttle-H1; 3-5 重组腺病毒穿梭质粒质粒p-shuttle-CTGF;
图 3 重组腺病毒穿梭质粒p-shuttle-CTGF的酶切鉴定
2.3 腺病毒载体的滴定和感染性鉴定:
采用TCID50法对病毒进行滴定,测出病毒保存液滴度为4×1010 PFU/ml。用MOI为100的目标病毒Ad.H1-CTGF和阴性对照病毒Ad.H1-Con感染HSC-T6细胞,未感染病毒的HSC-T6细胞为对照。病毒感染细胞7d后,目标病毒Ad.H1-CTGF组(A)和阴性对照病毒组Ad.H1-Con(B)均有大量空斑形成,未感染病毒的HSC-T6细胞未见空斑形成(C),说明构建的目标病毒和阴性无关对照病毒均具有较好的感染性。
A:目标病毒Ad.H1-CTGF;B:阴性对照病毒Ad.H1-Con;C: 未感染病毒
图4:包装的腺病毒感染的滴定
2.4 腺病毒载对CTGF基因沉默的Western Blot鉴定:
Western免疫印迹法检测发现,内参照蛋白β-actin的表达水平在6组之间无明显差异;而CTGF蛋白表达在包装的4组目标病毒感染HSC-T6细胞后均有不同程度降低,其中含靶序列TS3的病毒感染组降低最显著;无关序列阴性对照病毒感染组CTGF蛋白表达与未感染细胞组一样未见降低(图5)。提示构建的含TS3靶序列的腺病毒载体具有较好的CTGF基因沉默效果,命名为Ad.H1-CTGF,可作为以后抗纤维化研究的工具。
1:未感染组; 2: TS1组; 3:TS2组;4:TS3组;5:TS4组;6:TS5(无关序列)组
图5: 各组病毒对CTGF蛋白表达的影响
3 讨论
我国是肝病大国,随着慢性肝病病程的延续,其纤维化的进程也一直持续,由于目前缺乏行之有效的根治办法,这些人都面临着肝硬化的潜在威胁,这已成了严峻的社会问题。因此,寻找有效的抗纤维化方法,阻止慢性肝病患者的肝硬化趋势,已成为我国乃至全球亟待解决的问题。
肝纤维化的成因,普遍认为与肝星状细胞(HSC)的活化有关[6], TGF-β是目前公认的致纤维化最强的细胞因子之一,其促纤维化作用主要是通过诱导其下游因子CTGF的表达,活化HSC来完成。业已证明,CTGF与肝、肺、肾等器官的纤维化,皮肤瘢痕形成,创伤修复及动脉粥样硬化密切相关[7]。由于CTGF的生物学效应相对单一,主要介导TGF-β的促细胞增殖和ECM合成等作用。因此,阻断CTGF表达或抑制其活性,可能是一种更特异、更有效地防止肝纤维化的手段。
RNAi技术具有高效性和高特异性,作为关闭基因的新技术,已被广泛应用 [8]。 RNAi的产生需要向细胞内导入siRNA或者在细胞内表达siRNA,前者是将体外合成的siRNA直接导入细胞内,虽简单,但导入的siRNA易降解,且以瞬时表达为主,目前已较少使用;后者通过表达siRNA的质粒或病毒载体在靶细胞内转录siRNA,发挥RNAi作用,因方便、稳定和高效,成为主流方法。腺病毒载体可以直接、高效、稳定地感染细胞,避免了质粒转染效率低而带来的不便,逐渐成为该领域的研究热点[9-13]。
本文根据siRNA设计原则[4-5],设计4对针对CTGF基因的siRNA序列(TS1-TS4)和1对无关阴性对照序列(TS5),退火形成双链DNA并检测无误后定向克隆至pShuttle-H1的H1启动子下游,获得腺病毒穿梭质粒p-shuttle-CTGF1-5,酶切、测序鉴定无误后与骨架质粒pAdEasy-1共转染AD-293细胞,同源重组后获得4株腺病毒载体Ad.H1-CTGF1-4和1株阴性对照病毒Ad.H1-Con,空斑实验证实它们均具有较好的感染性,Western Blot检测发现,4组目标病毒对HSC-T6细胞CTGF蛋白表达均有不同程度的抑制,其中Ad.H1-CTGF3的抑制效果最好,抑制率达85%,达到了设计要求。该腺病毒载体的构建成功,将为抗纤维化的研究提供可行的工具,为肝纤维化和肝硬化的防治奠定基础。
参考文献
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